Cunoștințele de istorie bisericească – pe lângă importanța lor cognitivă deosebită – contribuie la consolidarea identității reformate. Nu se poate vorbi despre conștiință și identitate reformată fără a cunoaște originile și rădăcinile acestei comunități.
Scopul disciplinei Istoria Bisericii Protestante II este familiarizarea studenților cu istoria Bisericii Reformate din Transilvania în secolul al XVII-lea și cu politica religioasă a Principatului Transilvaniei.